Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp4Q60972 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms