Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Psme4Q5SSW2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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