Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccnl1Q52KE7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccnl1Q52KE7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms