Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Esf1Q3V1V3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Esf1Q3V1V3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Esf1Q3V1V3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Esf1Q3V1V3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Esf1Q3V1V3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Esf1Q3V1V3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Esf1Q3V1V3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Esf1Q3V1V3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Esf1Q3V1V3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms