Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smim9Q3V0X1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms