Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm28047Q3US59 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm28047Q3US59 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm28047Q3US59 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm28047Q3US59 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Gm28047Q3US59 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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