Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms