Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms