Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms