Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp30Q3UN04 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp30Q3UN04 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms