Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UJP5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Q3UJP5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q3UJP5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms