Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mier3Q3UHF3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms