Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms