Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

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Length 965 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Tbc1d2bQ3U0J8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbc1d2bQ3U0J8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tbc1d2bQ3U0J8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tbc1d2bQ3U0J8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms