Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cwc27Q3TKY6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cwc27Q3TKY6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms