Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col6a2Q02788 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms