Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms