Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Mc1rQ01727 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms