Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grin2cQ01098 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms