Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2bQ01097 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2bQ01097 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms