Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atp9bP98195 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms