Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Taf1bP97358 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms