Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga11P61622 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga11P61622 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Itga11P61622 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Itga11P61622 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms