Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P58686 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P58686 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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P58686 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P58686 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms