Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ctdsp1P58466 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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