Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClgnP52194 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms