Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtbrP50284 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LtbrP50284 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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