Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LmnaP48678 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LmnaP48678 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LmnaP48678 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms