Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
VhlP40338 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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VhlP40338 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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VhlP40338 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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VhlP40338 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
VhlP40338 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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