Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nedd1P33215 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nedd1P33215 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nedd1P33215 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nedd1P33215 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nedd1P33215 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nedd1P33215 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nedd1P33215 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nedd1P33215 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nedd1P33215 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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