Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gsx2P31316 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gsx2P31316 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms