Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RxraP28700 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RxraP28700 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
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