Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
U2af2P26369 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
U2af2P26369 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms