Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PparaP23204 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PparaP23204 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PparaP23204 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PparaP23204 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms