Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PrkcaP20444 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms