Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnnc1P19123 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms