Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
H2-Ab1P01921 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms