Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BlmO88700 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BlmO88700 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BlmO88700 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BlmO88700 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BlmO88700 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BlmO88700 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BlmO88700 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BlmO88700 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BlmO88700 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BlmO88700 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BlmO88700 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BlmO88700 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BlmO88700 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BlmO88700 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BlmO88700 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BlmO88700 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BlmO88700 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BlmO88700 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BlmO88700 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BlmO88700 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BlmO88700 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BlmO88700 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BlmO88700 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
BlmO88700 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BlmO88700 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BlmO88700 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BlmO88700 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BlmO88700 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BlmO88700 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BlmO88700 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 271.7 ms