Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops6O88545 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cops6O88545 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops6O88545 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cops6O88545 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cops6O88545 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cops6O88545 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cops6O88545 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops6O88545 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cops6O88545 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cops6O88545 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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