Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
DffaO54786 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
DffaO54786 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
DffaO54786 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
DffaO54786 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
DffaO54786 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DffaO54786 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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DffaO54786 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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DffaO54786 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DffaO54786 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms