Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Prrt1O35449 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Prrt1O35449 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Prrt1O35449 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Prrt1O35449 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Prrt1O35449 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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