Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Smim18J3QNP2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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