Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm3727J3QM54 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3727J3QM54 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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