Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cldn34c3J3QJW5 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Cldn34c3J3QJW5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Cldn34c3J3QJW5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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