Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm28038F7BCN9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm28038F7BCN9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms