Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms