Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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R3hdm1E9Q9Q2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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R3hdm1E9Q9Q2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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R3hdm1E9Q9Q2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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R3hdm1E9Q9Q2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
R3hdm1E9Q9Q2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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R3hdm1E9Q9Q2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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