Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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