Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm20425E9Q035 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms