Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc8E9PWG2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms